MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017857	CTA	2	6	1507735	1507740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017857	GTTTT	2	10	1509277	1509286	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017857	GTA	2	6	1510669	1510674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017857	GGA	2	6	1510727	1510732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017857	AGCTT	2	10	1510844	1510853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3506	NC_017857	T	6	6	1510861	1510866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017857	GTT	2	6	1510917	1510922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017857	CAT	2	6	1510932	1510937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017857	CAA	2	6	1510973	1510978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017857	TTTAA	2	10	1511579	1511588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017857	GT	3	6	1511626	1511631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017857	CAGG	2	8	1511681	1511688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_017857	TG	3	6	1515446	1515451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017857	TAA	2	6	1515470	1515475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017857	GCA	2	6	1515476	1515481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017857	TATT	2	8	1515523	1515530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017857	AGC	2	6	1515703	1515708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_017857	TAAAA	2	10	1515741	1515750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017857	A	7	7	1515747	1515753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017857	GA	4	8	1515770	1515777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017857	CAT	2	6	1516803	1516808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017857	CA	3	6	1517700	1517705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_017857	TTTA	2	8	1521122	1521129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017857	T	7	7	1521201	1521207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017857	TGC	2	6	1521238	1521243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_017857	AGC	2	6	1521262	1521267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_017857	T	6	6	1523029	1523034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017857	TTG	2	6	1526603	1526608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017857	GCC	2	6	1527803	1527808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017857	TGT	2	6	1527811	1527816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017857	CCA	2	6	1527827	1527832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_017857	TAAA	2	8	1527931	1527938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017857	CGA	2	6	1527939	1527944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017857	GTG	2	6	1527955	1527960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017857	CAA	2	6	1527973	1527978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017857	AGA	2	6	1529034	1529039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017857	TCT	2	6	1529057	1529062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017857	TTGA	2	8	1530345	1530352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017857	AGG	2	6	1536822	1536827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017857	TG	3	6	1539063	1539068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017857	A	7	7	1539113	1539119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017857	CTTT	2	8	1541536	1541543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_017857	GCC	2	6	1543036	1543041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_017857	GGC	2	6	1543046	1543051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017857	GGAA	2	8	1543720	1543727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017857	TTAA	2	8	1543767	1543774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017857	CCA	2	6	1543812	1543817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_017857	CTG	2	6	1543818	1543823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_017857	CAA	2	6	1543841	1543846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017857	GC	4	8	1543976	1543983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_017857	TCG	2	6	1543997	1544002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017857	TTGA	2	8	1544105	1544112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017857	CAA	2	6	1544151	1544156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_017857	T	6	6	1544212	1544217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017857	A	6	6	1546288	1546293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3558	NC_017857	CGAAT	2	10	1550404	1550413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3559	NC_017857	A	9	9	1550420	1550428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017857	TAAC	2	8	1550485	1550492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_017857	GA	3	6	1550533	1550538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017857	CGC	2	6	1550585	1550590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_017857	AGG	2	6	1550595	1550600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017857	ATT	2	6	1550638	1550643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3566	NC_017857	ATC	2	6	1550659	1550664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_017857	ATT	2	6	1550674	1550679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017857	AAAT	2	8	1550714	1550721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017857	T	6	6	1550727	1550732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017857	TAT	2	6	1550761	1550766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017857	TCA	2	6	1550809	1550814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017857	T	6	6	1552647	1552652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017857	T	7	7	1552740	1552746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017857	A	6	6	1552752	1552757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017857	T	7	7	1552763	1552769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017857	AT	3	6	1552777	1552782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017857	TTAT	2	8	1552796	1552803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_017857	TCA	2	6	1553203	1553208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017857	TG	4	8	1553246	1553253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017857	A	7	7	1553271	1553277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017857	AG	3	6	1553327	1553332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017857	CTGC	2	8	1554522	1554529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_017857	TTTA	2	8	1554536	1554543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_017857	CAA	2	6	1554634	1554639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_017857	A	6	6	1565898	1565903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017857	TAAT	2	8	1567920	1567927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_017857	ATA	2	6	1568543	1568548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017857	T	7	7	1569249	1569255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017857	GTG	2	6	1569270	1569275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017857	CG	3	6	1569289	1569294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017857	TGG	2	6	1571441	1571446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017857	TAG	2	6	1571507	1571512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017857	AG	3	6	1571515	1571520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017857	GGT	2	6	1575317	1575322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017857	ATT	2	6	1575342	1575347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_017857	GCA	2	6	1578210	1578215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_017857	TC	3	6	1584715	1584720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_017857	GTC	2	6	1586103	1586108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017857	TGC	2	6	1586153	1586158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017857	TA	3	6	1586188	1586193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017857	TGG	2	6	1586209	1586214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3626	NC_017857	GAAT	2	8	1586462	1586469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017857	GCAG	2	8	1586549	1586556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_017857	CCAA	2	8	1586592	1586599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_017857	GAA	2	6	1586607	1586612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_017857	ACCA	2	8	1586683	1586690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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